No local em que hoje é a cidade,
havia, antes da sua fundação como Vila,
uma tribo de índios guaianás denominada
(taba) - (ybaté) - de onde se originou o nome
do município.
Como a colonização não havia
chegado a região do Vale do Paraíba,
a donatária dessas terras,a Condessa de Vimieiro,
neta e herdeira de Martim Afonso de Sousa, necessitou
realizar a demarcação da posse dessas
terras.
No ano de 1628, recebe concessões de terras
e na data de 13 de outubro de 1639 a autorização
para construção da igreja matriz, cadeia
pública, , casa para o conselho, arruamento,
engenho de cana-de-açúcar e farinha
de milho, além de concessão de terras
tambem para outras famílias.
Em 5 de dezembro de 1645, , recebe a denominação
de Vila, com o nome de São Francisco das Chagas
de Taubaté, sendo assim escolhido oficialmente
seu padroeiro. Com o abastecimento das bandeiras tanto
vindas da Vila de São Paulo de Piratininga
quanto saídas da própria Vila de Taubaté,
esta alcançou relativa prosperidade,.entre
1690 e 1715